1、水彩笔笔头一般是圆的，而马克笔头是扁的；

2、水彩笔一般是12色、24色、36色一盒装卖，而马克笔大部分可以散的卖；

3、马克笔分水性和油性2种，而水彩笔只有1种水性，

4、水彩笔的优点是水分足，色彩丰富，鲜艳，缺点是水分不均匀，过渡不自然，两色在一起不好调和，所以一般适合画儿童画；马克笔的优点是水分均匀，色彩对比弱一些，2种色彩可以很好的协调，可以画建筑效果图，工业设计效果图，以及POP广告等等。