法学部。为东大历史最老，也是声望很高的学部，日本历史上很多政界要人均出自该学部。设有民主、公法、政治学 3 系，附属部门有外国法文献中心，近代日本法政史资料中心。文学部。设文学、史学、语言学、行动学 4 系，附设文化交流，北海文化研究两实习实验部门。该学部亦出过众多名扬日本的文学家、诗人、俳名作家、艺人等明星。教育学部。设教育学、教育心理学、学校教育、教育行政、体育和健康教育 5 系，附属学校有中学、高中各一所。医学部。有医学、健康护理学两系，附设脑研究实验室、医学电子实验室、声音语言医学实验室、实验动物饲养室，两所附属医院，附属学校有养护学校、接生护士学校。该学部以外科，特别是脑外科在世界上十分有名。理学部。设数学、信息科学、物理、天文、地球物理、化学、生物化学、生物科学、地学 9 系，附属部门有临海实验场、植物园、基本粒子物理国际中心、天文学教学研究中心等。