樟木头地铁站在东莞1号线支线与广深铁路在樟木头火车站形成衔接的位置上。樟木头火车站位于广东省东莞市樟木头镇,为广深铁路及京九铁路的车站，由广州铁路集团广深铁路股份有限公司管辖，来往广州和深圳的广深城际列车“和谐号”动车组的大部分班次均会停靠樟木头火车站。