有机宝石是由古代生物和现代生物作用所形成的符合宝石工艺要求的有机矿物或有机宝石。是来自于含有有机材料，皆由生物所衍生的。天然有机宝石高雅温馨、光彩迷人。市场上常见的如珍珠、琥珀、象牙等。养殖珍珠(简称"珍珠")虽然有部分人工因素，但养殖过程与天然相似，故也归于天然一类。例如:珍珠，珊瑚，琥珀，煤玉，象牙，砗磲，龟甲，动物的化石等。