1、作者不同：《天工开物》作者为明朝宋应星；《齐民要术》作者为北魏末年贾思勰；

2、内容不同：《天工开物》书中强调人类要和自然相协调、人力要与自然力相配合，更多地着眼于手工业，反映了中国明代末年出现资本主义萌芽时期的生产力状况；《齐民要术》系统地总结了六世纪以前黄河中下游地区劳动人民农牧业生产经验、食品的加工与贮藏、野生植物的利用，以及治荒的方法，详细介绍了季节、气候、和不同土壤与不同农作物的关系；

3、地位不同：《天工开物》是世界上第一部关于农业和手工业生产的综合性著作，是中国古代一部综合性的科学技术著作，有人称它是一部百科全书式的著作，外国学者称它为中国17世纪的工艺百科全书；《齐民要术》是一部综合性农学著作，也是世界农学史上最早的专著之一，是中国现存最早的一部完整的农书，被誉为中国古代农业百科全书。