1、防混放。化肥混放在一起，容易引起肥效降低。如硫酸铵、氯化铵等铵态氮肥，遇到草木灰、石灰等碱性物质时，会引起氨的挥发损失。过磷酸钙、磷酸铵等水溶性磷肥，遇到碱性物质，会降低磷的有效性；

2、防标志名不副实。有的农户用复混肥袋装尿素，有的用尿素袋装复混肥或硫酸铵，还有的用进口复合肥袋装专用肥，这样在使用过程中很容易出现差错。如有位农户种大豆时用磷肥拌种，误把水泥当成钙镁磷肥去用，结果使大豆住进了“水泥房”，不透气，不透水，大豆也就不能发芽出苗；

3、防破袋包装。硝态氮肥料吸湿性强，吸水后会化为浆状物，甚至呈液体，应密封贮存，一般用缸或坛等陶瓷容器存放，严密加盖；也可用两只塑料袋包装后严密封口贮存。碳酸氢铵吸湿后会加快氨的挥发损失。过磷酸钙吸湿后，不仅容易结块，造成施用不便，而且还会引起磷的退化，使有效磷含量降低；

4、防火，特别是硝酸钾等硝态氮肥，遇高温(200℃)会分解出氧，遇明火就会发生燃烧或爆炸；

5、防腐蚀。过磷酸钙中含有游离酸，碳酸氢铵则呈碱性，这类化肥不要与金属容器或磅秤等直接接触，以免受到腐蚀；

6、防肥料与种子、食物混存，特别是挥发性强的碳酸氢铵与种子混放会影响发芽，应予以充分注意。

需要注意的就是有些化肥和农药性质不稳定，在贮存过程中释放出的气体会危害人体健康。