豆脐是种子在脱离珠柄后留在种皮上的痕迹。在豆脐靠近下胚轴的一端有珠孔，发芽时胚根可由此出生。而另一端为合点,是珠柄维管束与种脉连接处的痕迹。脐色是由无色到淡褐色，再到褐色，再到深褐色，最后到黑色的顺序进行变化的。由于角质化的栅栏细胞实际上是不通空气的，因此，豆脐区则成为了胚和外界之间空气交换的主要通道，其中的豆脐区为脐间的裂缝和珠孔。