南京大学、东南大学、南京理工大学、南京航空航天大学、河海大学、南京农业大学等学校有研究生。

1、南京大学创建于1902年，是中国最早进行研究生教育的大学之一。新中国成立以后，南京大学于1954年恢复研究生招生，到1965年，共招收276名研究生。1978年，南京大学又一次成为全国首批恢复招收研究生的高校之一。

2、东南大学是中央部属、教育部直属的副部级全国重点大学。 自1952年全国高校院系调整后就开始招收研究生，50年代后期和60年代初期共招收研究生117人，1978年恢复