二手房办理土地使用证的方式为：

1、一般在房管局交易大厅设有国土局办事窗口，可以凭房产证到该窗口办理。

2、已经进行不动产登记的地方现在发行不动产证，不再另外发国土证，不需要再单独去办理。

根据《城市房屋权属登记管理办法》规定：因房屋买卖、交换、赠与、继承、划拨、转让、分割、合并、裁决等原因致使其权属发生转移的，当事人应当自事实发生之日起90日内申请转移登记。