1、第一个结尾彩蛋：串联《复联3》、《复联4》。

电影《复仇者联盟3》的结尾彩蛋里，尼克·弗瑞在即将化灰之际，拿出了一个饰有惊奇队长星标传呼机发送了求救信号，随后便是一声“motherFuc…”。《惊奇队长》的结尾彩蛋衔接了这个场景。

2、第二个彩蛋：橘猫与宇宙立方。

第二幕则填补了上世纪90年代到2012年《复仇者联盟》上线期间，漫威的英雄空白期，同时也为《美国队长1》的一些线索画上了句号。

在神盾局的办公室，橘猫咕咕跳到了尼克·弗瑞的办公桌上，在《惊奇队长》中，咕咕吞掉了包含空间宝石的宇宙立方，现在咕咕则干呕着吐出了它。