二级主任科员属于正科级，但属于非领导职务，所以职位略低于现任科长、乡镇长等实职的正科级领导职务。职务工资上有区别，实职正科级略高于主任科员。

正科级的职务：科级单位的科长、地级市辖区、县各局局长（公安局局长高配为副处除外），街道办事处主任，乡镇党委书记、乡长,地级市公安局各支队的副支队长及支队下设大队的大队长，各单位主任科员。