影响细胞融合的因素有分子量与浓度，细胞融合效果与分子量及其浓度成正比；pH值，经验证，pH值在8.0~8.2之间融合效果最好；处理时间，处理时间越长，融合效果越好,但对细胞的毒害也就越大。细胞融合过程不存在有性杂交过程中的种性隔离机制的限制，为远缘物种间的遗传物质交换提供了有效途径。体细胞杂交产生的杂种细胞含有来自双亲的核外遗传系统，在杂种的分裂和增殖过程中双亲的叶绿体、线粒体DNA亦可发生重组，从而产生新的核外遗传系统。