1、不耐脏，硅藻泥，大多是淡雅色，容易留下小孩玩耍的各种污迹，虽然网上说用橡皮擦可擦掉，但也有人反映此方法并不见效。

2、不能擦洗，瓷砖防水，墙壁脏了，可用湿布擦拭，但硅藻泥是纳米蜂窝状结构，吸附性比活性炭高，一旦用水擦拭，起不到清洁的作用。另外，硅藻泥由于不能用水擦洗，一旦墙面弄脏，不能用水擦洗。

3、不防水，硅藻泥，不防水，不能用于潮湿场所，比如：厨房、卫生间。

4、要经常清理，硅藻泥能吸附有害物质，如长时间不清理，会改变墙壁的颜色，令环境肮脏不堪，所以墙壁要经常清理。

5、手感不佳，硅藻泥，摸起来粗糙，并没有油漆细腻，对于喜欢光滑手感的人来说，硅藻泥略显劣势。

6、花色不够丰富，与壁纸的花色、色彩、造型相比，硅藻泥肌理图案单调，不够丰富。

7、硬度不好，硅藻泥是“泥”，其硬度与瓷砖无法相比，据了解：用质量不好的硅藻泥，被碰撞后会一块块掉下来。

8、价格较贵，硅藻泥价格较高，一般在三四百元/平米，普通家庭不会选择这么贵的材料，所以那就是有钱人的玩意。