1、如果双方协商一致由一方抚养两个孩子，按照双方当事人的意思出具判决书;

2、如果双方不能就孩子抚养协商一致，如果有特殊情况，可能会将两个孩子的抚养权判给一方，比如两个子女都未满两周岁的，一般会判给母亲;如果一方有特殊情况，法官可以对其优先考虑，比如一方已经丧失了生育能力的，一方无其他子女而另一方有其他子女的。

如果没有特殊情况想要取得两个孩子的抚养权，应主要从两个方面做工作，一是子女由自己抚养有利于其成长，二是子女由对方抚养不利于健康成长。

《婚姻法》第三十六条规定，哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。