菏泽市内公办的大学是有五所的，分别是菏泽学院、齐鲁工业大学菏泽校区、菏泽医学高等专科学校、菏泽职业学院、菏泽家政职业学院，其中齐鲁工业大学菏泽校区是山东齐鲁工业大学与菏泽市人民政府联合创建的一所高等教育院校，菏泽医学专科学校是一所由山东省人民政府举办的省属公办全日制普通高等专科学校。