细胞分化的根本原因是细胞核中基因的选择性表达，细胞分化是指在个体发育中，由一个或一种细胞增殖产生的后代，在形态，结构和生理功能上发生稳定性差异的过程。但又由于同一个生物体内不同的细胞都来自于同一个受精卵，所以不同细胞中遗传物质相同，但是不同的细胞表达的基因不同，所以不同的细胞形态结构和功能不同，即这是基因选择性表达的结果。