河海大学是一所拥有百年历史，以水利科学为特色，工科为主，理、工、经、管、文多学科协调发展的教育部直属全国重点大学，其水利及支撑学科人才梯队的综合实力处于国内一流地位，为中国水利科学的最高学府。

南京理工大学，简称“南理工”，位于古都南京市，北依紫金山，西临明城墙，是一所隶属于中华人民共和国工业和信息化部的全国重点大学，位列“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校，入选“双一流”世界一流学科建设高校，素有“兵器技术人才摇篮”的美誉。

河海大学水利方面的专业较好，南理工的兵器科学与技术学科比较突出。总之，两所高校的教学方面各有侧重，可根据自身兴趣及条件来选择就读。