PCR存在平台期的常见原因是底物耗尽或多次循环后polymerase失活，反应速率下降，但是即使底物量趋于无限，酶活稳定，PCR也会有平台期，因为PCR反应本质上也是一个酶促反应。它也会有化学平衡，也服从勒夏特列原理。当DNA合成速率等于水解速率的时候，就是理论上的平台期。