黄蜡石的化学成分主要为二氧化硅，含有少量的三价高铁离子及少量微量元素，矿物成分主要是石英，属于石英岩，少数情况下可有玉髓、玛瑙、水晶等成分。黄蜡石的颜色多种多样，纯净为白色，因其含各种色素和杂质，颜色反而丰富多彩。
