青苔鼠鱼是杂食性鱼类，对食物的接受度较强，丰年虾、冻红虫、水蚯蚓、水蚤、青苔、其它食物残渣都是来者不拒。

在青苔鼠鱼栖息地它们主要生活在江边浅滩水流较为缓和的地方，它们依靠斜向下方的吸盘状口部，吸贴于水草岩石等物而徐徐移动，在人工饲养环境中它们通过吃青苔和剩余的食物以达到清理水族箱的效果。