细胞核中的染色质(体)内含有脱氧核糖核酸，属酸性物质，可电离出H+，而使自身带正电荷，所以它能和碱性染料电离出的有色阳离子通过电荷间的引力作用牢固结合，从而被染上颜色。一般不溶于水及酒精。通常能电离出无色的阴离子和有色的阳离子，如龙胆紫、亚甲基蓝、美蓝等。碱性染料的阳离子为有色离子，它可以与细胞中的带负电荷部分牢固地结合。