指山地区冬暖夏凉，不受寒潮侵袭，也不受台风影响。由于独特的气候条件，使五指山生物种类繁多，植被分布为热带自然景观。土地组成以中酸性喷岩为主，加上历年植被的枯枝落叶腐烂，土地较肥沃，适于热带和亚热带植物生长。

五指山由于海拔高，纬度低，森林密布，光、热、水资源丰富。此地气候温和，属热带山区气候。年平均气温22、4度，1月平均气温17度，7月平均气温26度，极端最高气温35、9度。年平均降雨量为1690毫米，极端最大年降雨量为2810、4毫米，极端最少年降雨量为1055、5毫米，年平均相对湿度为百分之八十四，年平均日照为2000小时左右，有“天然别墅”和“翡翠城”之称。