1、自制果醋的危害是无法控制环境卫生，容易导致水果出现发霉或者变质腐烂等情况，不能及时发现，导致食物中毒，所以自己制作果醋一定要注意禁忌和方法。

2、受到家庭环境的影响，很难保证在制作过程中杀菌完全，因此就会导致一些厌氧微生物在制作的苹果醋中大量繁殖，如果情况不是特别严重的是很难分辨出来的，所以人们会在很大程度上进行饮用。但是在饮用之后，就很有可能出现腹泻等症状，严重情况下还会影响正常的身体健康。