莲花镇辖19个行政村，其中军营、淡溪、白交祠、西坑、小坪、水洋、尾林7个村分布在海拔500米至1000米的山上；蔗内、内田、上陵、罗溪分布在海拔150米至500米的半山腰；美埔、溪东、莲花、后埔村、窑市、云洋、云埔、 沃溪分布在海拔100米以下的平原地带。