付款申请单在没有实际付款时，是不能做账务处理的，只有公司领导批准，财务付款时才能做账务处理。付款申请单一般是用于写明支付款项的金额、支付的用途、提请支付的部门及支付的内容等，做为衔接相关部门与财务部门付款的要求提请，如为支付货款，后应有相关的附件，如付款合同、发*及入库单，证明此项付款为真实性的交易。