只能识别一种核苷酸序列。因为一种限制酶只能识别一种特定的核苷酸序列，并在特定位点进行切割，这是酶专一性的典型表现。限制酶是识别特定的核苷酸序列，并在每条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类酶。根据酶的功能特性、大小及反应时所需的辅助因子，限制性内切酶可分为两大类。