商业房产土地使用税从价计征的，其计税依据为房产原值一次减去10%-30%后的余值；从租计征的（即房产出租的），以房产租金收入为计税依据。从价计征10%--30%的具体减除幅度由省、自治区、直辖市人民政府确定。房产税税率采用比例税率。按照房产余值计征的，年税率为1.2%；按房产租金收入计征的，年税率为12%。房地产开发企业的土地使用税在税款的计算方面并没有什么特别的规定。其计算公式仍然为：应纳税额=计税土地面积×适用税率。对此，《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第三条作了明确规定：“土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算征收。”如果硬要说有什么不同，那么就是有关税收优惠政策上的区别，即房地产开发企业用于建造商品房的土地曾经有过一定的税收优惠。