处理合同效力纠纷的方法是：

1、当事人自行协商解决合同纠纷，当事人在自愿互谅的基础上达成和解协议；

2、调解，双方当事人自愿在第三者的主持下进行调解；

3、仲裁，由第三者依据双方当事人在合同中订立的仲裁条款或自愿达成的仲裁协议；

4、诉讼，是解决合同纠纷的最终形式。

【法律依据】

根据《合同法》第四十四条，依法成立的合同，自成立时生效。法律、行政法规规定应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。