水晶泥是有毒的，内含很多重金属和芳香类化合物，无论是皮肤接触还是吸入它们的挥发物质，都会对人体有害。如果儿童误食，很可能会在消化系统中吸收水分而膨胀，影响宝宝的肠胃健康。水晶泥里含有硼砂，硼砂属于化工产品，毒性较高，包括中国在内的世界多国禁止用于食品添加物。

硼砂进入人体内，可与胃酸作用产生硼酸，可能会导致急性中毒，通常表现为呕吐、腹泻等。此外，硼砂对人体更主要的危害是长期接触会在体内慢慢蓄积，干扰消化系统酶的作用，引起食欲减退、消化不良等反应。