1、形态：海水珍珠一般呈比较规则的正圆球形，而淡水珍珠则比较多的呈椭圆、扁圆形，且表面褶纹多。

2、大小：海水珍珠一般较淡水珍珠大，海水珍珠的珠径一般为6~7.5毫米，而淡水珍珠的颗粒则要小得多。

3、密度：一般海水珍珠的密度小于淡水珍珠；

4、生长周期：一般海水珍珠的生长周期为三年，而淡水珍珠则为一~二年；

5、成活率：一般海水珍珠的成活率为50%，而在此范围内的成珠者仅有40%；而淡水珍珠的成活率则要高得多；

6、珍珠产量：一般三个海水珠母贝才产生一个珍珠，而一个淡水珠母贝可以形成大约20个珍珠；

7、生长环境：海水珍珠更多是在开放的天然海水中生长（里面有更多的营养成分与浮游生物），而淡水珍珠则更多的是在相对封闭的水域环境中生长；

8、药用功效：海水珍珠的药用成分含量一般高于淡水珍珠，药用价值更高；