1、基因（遗传因子）是具有遗传效应的DNA片段。DNA即脱氧核糖核酸，又称去氧核糖核苷酸，是染色体主要组成成分，同时也是主要遗传物质。

DNA序列或基因序列是指使用一串字母（A、T、C、G）表示的真实的或者假设的携带基因信息的DNA分子的一级结构。

2、碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物，是核酸、核苷、核苷酸的成分。

碱基序列就是由ATCG四种碱基组成的，组成的序列可以编码氨基酸。三个碱基编码一个氨基酸。

3、联系：

碱基序列通常是指核苷酸序列，包括核糖核酸序列和脱氧核糖核酸序列（即DNA序列和RNA序列）。

DNA序列就是指DNA链的脱氧核糖核苷酸的排列顺序。

基因是指具有遗传效应的DNA片段。并非所有DNA都是基因。所以基因序列就只是指具有遗传效应的DNA序列（即能翻译出蛋白质的DNA序列）。