灵活就业人员和企业在职职工，实际上他们是不同的两个群体，两者缴纳的社保在退休后养老金计算方式和医保的报销比例方面是一样的，区别主要体现在以下几个方面：

1、一般来说，灵活就业人员只需要缴纳基本医疗保险和基本养老保险两个险种，相对于上班职工来说少了生育保险、失业保险和工伤保险，因此也不能享受到相关的待遇。

2、灵活就业人员需要个人承担一部分的统筹缴费；

以养老金为例，如果在单位缴纳的话，个人承担8%，单位承担20%进入统筹账户；如果灵活就业人员缴纳，个人承担全部20%，但其中仍然只有8%进入个人账户，另外的12%进入统筹账户。

3、部分地区灵活就业的女性要55岁才能退休，而普通女工人只需要50岁就可以退休。

4、由于灵活就业人员缴费比例或金额通常低于企业职工，所以一般情况下，企业职工退休后的养老金待遇会高于灵活就业人员的养老金待遇。

5、国家针对不同类别的灵活就业人员推出不同的社保优惠、社保补贴政策，上班职工无法享受到。