补充借贷合同的协议有效。补充协议与原借款合同一样都具有法律效力。如果两份合同产生矛盾的，以时间在后的约定条款为准执行。因为如果以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。

【法律依据】

《民法典》第六百六十八条，借款合同应当采用书面形式，但是自然人之间借款另有约定的除外。

借款合同的内容一般包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。