东京也无非是这样出自《藤野先生》，东京也无非是这样”，“无非”是“只不过”的意思，“这样”指“清国留学生”的种种丑行。这一句表达了作者对“清国留学生”在东京造成恶浊气氛的厌恶和对东京失望的感情，并引起下文对“清国留学生”丑态丑行的描写，也为后文写“到别的地方去看看”埋下伏笔。

作者通过怀念藤野先生，赞扬藤野先生没有民族偏见的伟大性格和正直、热忱、高尚的品质，回顾了自己在日本求学时期探索救国道路和思想转变的过程：为了祖国的前途和命运，毅然地放弃了跟随生平最敬爱的老师一一藤野先生学习医学，摈弃了科学救国的改良主义道路，改为从事文艺运动以唤醒人民群众起来革命；从而激励自己要永远不忘革命的初衷，决心同封建及帝国主义势力斗争到底。