当金刚菩提里有灰尘的时候，首先将其放在温水中浸泡半个小时，这样能软化表面的污垢。之后用硬毛刷粗刷一次，还要保证每个部位都能刷到，再放在清水中重新刷洗一次，清洗干净后放在干毛巾上揉搓即可。

当金刚菩提里面有很多灰尘的时候，由于表明的纹路很多且较深，这时候可先将其放在清水中浸泡半个小时左右，主要以常温的自来水为宜，但要注意泡水的时间不宜过久，这样能软化里面的污垢。

当金刚菩提泡一段时间后，再用硬毛刷简单的粗刷一次，主要以垂直的角度擦洗表面，还要让每个部位都能均匀的刷到，之后再将其放在清水中用力的搅动，这样能将表面的残渣清理干净。

由于金刚菩提表面的纹路缝隙很深，当进行简单的粗刷后，再放在温水中重新刷洗一次，等完全清理干净后，捞起来放在干净的毛巾上包起来，再用手轻轻的揉搓，将表面上的水分擦干即可。