埃及全国干燥少雨，气候干热。埃及南部属热带沙漠气候，夏季气温较高，昼夜温差较大。尼罗河三角洲和北部沿海地区，属亚热带地中海气候，气候相对温和，其余大部地区属热带沙漠气候。白尼罗河发源于南半球的热带草原气候区，青尼罗河发源于北半球的热带草原气候区，两河汛期不同。

1月平均气温12摄氏度，7月26摄氏度；全境干燥少雨，年均降水量50毫米到200毫米。余大部地区属热带沙漠气候，炎热干燥，气温可达40摄氏度 。每年4月到5月间常有“五旬风”，夹带沙石，损坏农作物。