欠款协议的诉讼时效的计算是从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算，时效期限为3年；如果没有约定还款期限的，适用20年的最长诉讼时效；如果对方明确表示拒绝还款的，从拒绝之日开始计算。

【法律依据】

根据《民法总则》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。