1、品种不同：青花椒属于芸香目芸香科下的花椒属植物，其果实呈圆形，绿豆大小，山胡椒属胡椒目，胡椒科、胡椒属木质攀援藤本，果实为圆形的浆果，可食部仅仅为浆果。

2、外形不同：青花椒生时为青色，一柄多籽，成熟后为红色，籽黑色，山胡椒生时为青色，成熟后取其籽为乳白色。

3、成分不同：花青椒的主要调味成分是其含有的挥发性的烯类物质，山胡椒的主要增香调味成分是其含有的植物碱和胺类成分。

4、用途不同：青花椒在调味品上合适任何食物，尤其是肉类和蔬菜类适量释放，香味浓郁，山胡椒主要用在汤食的调味上。